個人所得稅以支付所得的單位或個人為扣繳義務(wù)人。個人取得工資薪金，勞務(wù)報酬，稿酬，特許權(quán)使用費，經(jīng)營所得，財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得，財產(chǎn)租賃所得，偶然所得，利息股息紅利所得，都要繳納個人所得稅。
企業(yè)給員工發(fā)放工資，企業(yè)就是支付所得的單位，作為法定扣繳義務(wù)人，這是最常見最典型的需要扣繳個人所得稅的情形。
2019年新個人所得稅法實施后，工資薪金所得個人所得稅的計算方法發(fā)生了變化，現(xiàn)在是按年計算，按月預扣預繳稅款，年終匯算清繳，因此企業(yè)在發(fā)放工資時也只是預扣稅款，待到次年3月到6月由納稅人自行匯算，多退少補。
企業(yè)在發(fā)放工資時預扣稅款基本都是采用網(wǎng)絡(luò)申報，稅局會有一個申報軟件，下載安裝到電腦上，就可以操作了，如果實在不會計算稅款，也可以將基礎(chǔ)數(shù)據(jù)填入系統(tǒng)，系統(tǒng)會自動計算稅款的。
企業(yè)如果在發(fā)放工資時不扣繳個人所得稅，是會承擔法律責任的，有涉稅風險。根據(jù)稅收征收管理法，企業(yè)應扣未扣稅款的，稅務(wù)機關(guān)可以進行處罰。
